2013年6月，南京“亚青”进入55天倒计时，为迎接亚青盛会的召开，确保亚青赛、前赛事期间环境安全，根据青奥组委统一部署，南京市环境保护局牵头成立“青奥应急指挥中心”。南京市环境监测中心站积极配合市环保局开展相关筹备工作，开辟专门会议室，调配硬件，配置网络，保障到位。南京市站还编写了《南京市亚青（青奥）会环境监测保障方案》、《亚青会环境监测工作实施方案》及《保障亚青会环境监测行动方案》，并建立“亚青”应急保障人员梯队，全站监测人员上下联动，打造过硬“亚青”环境监测保障体系。